湖南中医药大学期刊杂志社组建于2012年3月，其前身为《湖南中医学院学报》编辑部，杂志社由学校辖管，下设1个办公室和3个编辑部，现有职工12人，其中正高1人，副高1人，中级职称6人，博士5人，硕士7人。目前公开出版发行的刊物有《湖南中医药大学学报》（月刊）、《数字中医药（英文）》（季刊）、《药食同源杂志》（月刊）。
《湖南中医学院学报》创刊于1979年，2006年10月更名为《湖南中医药大学学报》，是国内外公开发行的中医药、西医学、中西医结合学术刊物，隶属于中华中医药学会联盟期刊。本刊积极反映国内外该学科中最新科研、医疗、教学成果和学术成就，注重学术水平，版式编排规范，印刷装帧美观大方，连续数年被科技部信息所收录为统计源期刊。多次荣获全国高校优秀科技期刊奖、全国高校学报编辑质量优秀奖、湖南省“十佳科技期刊”。入选2023 年度中医药中文科技期刊分级目录T2级期刊。
《数字中医药（英文）》2016年成功入选中国科技期刊影响力提升计划第二期项目，2018年正式出版发行，隶属于中华中医药系列期刊，并已正式被CSCD核心库、Scopus数据库收录。其创办填补了数字中医药领域英文科技期刊的空白，将成为面向世界传播中医药科技知识和学术交流的重要平台，入选2023 年度中医药英文科技期刊分级目录T2级期刊。
《药食同源杂志》（CN43-1564/R）是由湖南中医药大学主管、主办的面向国内外公开发行的学术刊物（月刊）。本刊的办刊宗旨为：报道国内外最新的药食同源研究成果；传播药食同源研究新思路、新方法、新技术、新成果；挖掘药食同源类产品的养生保健和治未病功能；促进药食同源学术和文化的传承创新和繁荣发展；促进药食同源产品开发与研究。
《数字中医药与诊断》（内刊）其前身为由中华中医药学会中医诊断专业委员会主办，湖南中医学院中医诊断研究所承办的《中医诊断学杂志》，1995年创刊，2013年改刊名为此。《医学人文与管理》（内刊）是由湖南中医药大学主办的社科类综合性半年刊，2016年正式出版。
